西瓜定植后始见发病，发病初期晴天中午出现暂时性萎蔫，初期还能恢复；后终因不能恢复而枯死，拔出根茎部可见水浸状褐色病变，剖开病根胫腐烂部已变色，严重的仅留下丝状输导组织，茎蔓内维管束一般不变褐。受害根根尖变黑，后蔓延到根茎，形成黑褐色病斑，病部表皮纵裂，皮下组织变黑。
发病薯苗叶色浅黄，生长迟缓，须根尖端和中部有黑褐色病斑。出苗较晚，出苗率显著减少。
地瓜根腐病主要发生在大田期。危害幼苗，先从须根或中部开始，局部变黑坏死，以后扩展至全根变黑腐烂，并蔓延至地下茎，形成褐色凹陷纵裂的病斑，皮下组织疏松。地上秧蔓节间缩短、矮化，叶片发黄。发病轻的，入秋后秧蔓上大量现蕾开花；发病重的，地下根茎全部变黑腐烂，主茎由下而上干枯，引起全株枯死。病薯块表面粗糙，布满大小不等的黑褐色病斑，中后期龟裂，皮下组织变黑。
红薯根腐病主要发生在大田期。危害红薯幼苗，先从须根或中部开始，局部变黑坏死，以后扩展至全根变黑腐烂，并蔓延至地下茎，形成褐色凹陷纵裂的病斑，皮下组织疏松。地上秧蔓节间缩短、矮化，叶片发黄。发病轻的，入秋后秧蔓上大量现蕾开花；发病重的，地下根茎全部变黑腐烂，主茎由下而上干枯，引起全株枯死。病薯块表面粗糙，布满大小不等的黑褐色病斑，中后期龟裂，皮下组织变黑。
病薯块表皮粗糙，还会出现很多大小不等黑褐色病斑，一般病斑初期不破裂，中后期纵横龟裂，皮下组织变黑色，但苦无味，煮吃无硬心和异味。