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地上部叶片褪绿发黄，并从叶尖开始（或局部）沿叶脉纵向软腐，植株矮小，生长发育失调，严重时植株死亡。地下部受到细菌侵染后，初生根由根尖向基部开始腐烂，而后侧生根、次生根接着腐烂，部分植株连“蒜母”一起腐烂，有鱼腥恶臭味。
大蒜根腐病发病后根部开始腐烂，表现出有黄叶。
