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主要发生在大豆根部，幼苗或成株均染病。初期茎基部或胚根表皮出现淡红褐色不规则的小斑，后变红褐色凹陷坏死斑，绕根茎扩展致根皮枯死，受害株根系不发达，根瘤少、地上部矮小瘦弱，叶色淡绿，分枝、结荚明显减少。
大豆发生根腐病是，根系生长不健壮，具体表现为毛细根少、根瘤数量少，甚至出现没有根瘤，根尖变为褐色。大豆根系受到危害，营养和水分的输送被阻断，造成地上植株失绿、变化、植株矮小、萎焉现象，严重时会造成死棵。
