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在防治上应采取综合措施。要对马铃薯青枯病采用以农业耕作栽培方法为主的综合防治措施，而且要以预防为主，杜绝各种浸染来源，并防止扩大传播。在马铃薯青枯病已传入并不断加重为害的情况下，要采取各种有效措施以减轻为害，最大限度地减少损失。对于综合防治措施的应用还要因地制宜：在不同地区，栽培制度不同，气候条件不同，菌系不同，应该对具体防治措施各有侧重。
栽种前清理好去年的残枝败叶，切断病菌传染源。做好种子消毒。
清除病株，种子用草木灰消毒，平衡施肥，及时排水。
