可用50%氯溴异氰尿酸可溶粉剂1000-1500倍液进行喷雾。
小麦赤霉病是小麦非常严重的病害之一，可以使用多菌灵、烯唑醇、咪酰胺、克百菌等农药品种防治，也可以施加磷酸二氢钾溶液、腐殖微酸肥等元素药剂同时防治伴生病症。对于病害较为严重的地段，需要施加两次药剂。
穗腐:小麦扬花时，初在小穗和颖片上产生水浸状浅褐色斑，渐扩大至整个小穗，小穗枯黄。湿度大时，病斑处产生粉红色胶状霉层。后期其上产生密集的蓝黑色小颗粒（病菌子囊壳）。用手触摸，有突起感觉，不能抹去，籽粒干瘪并伴有白色至粉红色霉。小穗发病后扩展至穗轴，病部枯褐，使被害部以上小穗，形成枯白穗。茎基腐:自幼苗出土至成熟均可发生，麦株基部组织受害后变褐腐烂，致全株枯死。秆腐:多发生在穗下第一、二节，初在叶鞘上出现水渍状褪绿斑，后扩展为淡褐色至红褐色不规则形斑或向茎内扩展。病情严重时，造成病部以上枯黄，有时不能抽穗或抽出枯黄穗。气候潮湿时病部表面可见粉红色霉层。
小麦赤霉病危害很大，会引起苗枯、穗腐、茎基腐、秆腐和穗腐等症状，主要由种子带菌引起，种芽会变成褐色，然后腐烂，出苗后麦苗黄瘦，容易死亡。