菌核病典型症状为：病部产生白色絮状白霉和黑色鼠粪状菌核。
整个生育期均可发病，结实期发生最重。茎、叶、花、角果均可受害，茎部受害最重。茎部染病初现浅褐色水渍状病斑，后发展为具轮纹状的长条斑，边缘褐色，湿度大时表生棉絮状白色菌丝，偶见黑色菌核，病茎内髓部烂成空腔，内生很多黑色鼠粪状菌核。病茎表皮开裂后，露出麻丝状纤维，茎易折断，致病部以上茎枝萎蔫枯死。
从开败的残花开始侵染，初呈水渍状腐烂，后长出较浓密的絮状白霉，随病害发展白霉上散生黑色鼠粪状菌核丝和黑色鼠粪状菌核，空气干燥时病茎坏死干缩，灰白至灰褐色，最后病部以上茎蔓及叶片枯死。叶片染病呈污绿色水渍状腐烂，病部亦长出白色菌丝和较细小的黑色菌核。
病部产生白絮状绕茎病斑和黑色鼠龚状菌核。
油菜菌核病在整个生育期都可发生以茎部初呈水渚状腐烂，后来湿度大时长出絮状白霉病茎坏死干缩，病部以上枯死，在病部长出黑色或褐色鼠粪状物。