发病初时，植株近地面茎基部先受害。病斑初为褐色水渍状，后扩展至整个茎部，使茎基部软腐，并在被害部位密生棉絮状白色菌丝体，后期产生菌核，有时茎基部还会出现开裂的症状。菌核初期为白色，后逐渐变为鼠粪状黑色颗粒状物。通常菌核病引起的腐烂没有恶臭，有别于细菌性软腐。莴笋染病后，植株下部叶片变软发褐，病害向上发展，上部叶片青枯状萎焉，茎秆发病，植株生长不良，重者整株枯死或倒伏。
该病为真菌性病害，多在近地面的茎部初呈水渍状，迅速向茎上部和根部扩展，致使病部组织软腐，表面密生白色棉絮状菌丝体。随后，菌丝体交织形成初呈白色后变为黑色鼠粪状的菌核。地上茎部和叶柄部受害，其症状相似。莴苣患病后，其地上部叶片迅速萎蔫，腐烂，最后全株死亡。