播种前用36%三唑·多菌灵悬浮剂100倍液浸种30分钟，晾干后直播。最好与非瓜类作物实行2～3年轮作。选择排水良好的高燥地种植。选用抗病品种，施足基肥，以优质复合肥为主，忌偏施氮肥。雨季到来之前开好三沟以利排水降湿。结瓜期适当追肥，防止脱肥早衰。植株发病后及时摘除病叶，收获后彻底清理瓜园病残株及其地边杂草，集中深埋或烧毁。及时药物防治。
药剂防治已经发生过蔓枯病的西瓜地，要在蔓长30厘米时开始喷药。初发现病株的地，要立即喷药，药剂可用40%福星乳油8000倍液或20%氟硅唑咪鲜胺800倍液，或75%百菌清可湿性粉剂600倍液或56%嘧菌酯百菌清800倍液，每隔5～7天喷一次，连喷2～3次。还可用70%甲基托不津可湿性粉剂800～1000倍液，或80%代森锌可湿性粉剂800倍液，或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，或50%混杀硫悬浮剂500倍液，或50%多硫胶悬剂500倍液，或36%甲基硫菌灵胶悬剂400倍液。每7～10天喷1次，连续防治2～3次。
加强栽培管理创造较干燥、通风良好的环境条件，并注意合理施肥，使西瓜植株生长健壮，提高抗病能力。要选地势较高、排水良好、肥沃的砂质壤土地种植。防止大水漫灌，雨后要注意排水防涝。及时进行植株调整，使之通风透光良好。施足基肥，增施有机肥料，注意氮、磷、钾肥的配合施用，防止偏施氮肥。发现病株要立即拔掉烧毁，并喷药防治，防止继续蔓延为害。
防治西瓜枯萎病最有效的方法是嫁接换根，用葫芦或新土佐等高抗枯萎病的葫芦科作物做砧木嫁接西瓜品种，只要注意彻底断掉西瓜根，苗子栽植时，不使嫁接口部位与土壤接触，就会有效地防止西瓜枯萎病的发生。
加强栽培管理，平整土地，排灌畅通，防积水，合理密植。及时整枝，加强通风透光，使用生物有机肥，提高作物抗性。发病初期用75%百菌清800倍、50%拌种双500倍、2%菌毒克毒300倍液喷雾防治，隔5~7天一次，连续2~3次。
药剂防治是控制该病最有效的方法。蔓枯病多在西瓜、甜瓜伸蔓后发生，当遇到降雨、连阴雨天气或田间浇水时，可用以下药剂进行防治：40%苯甲·吡唑酯悬浮剂20～25毫升/亩，或60%吡唑·代森联水分散粒剂60-100克/亩，325克/升苯甲·嘧菌酯悬浮剂40-50毫升/亩等药剂兑水30～50公斤均匀喷雾，可有效控制蔓枯病的蔓延。
西瓜蔓枯病治疗方法有三种。第一种是处理种子，在播种前将种子放在代森锰锌可湿性粉剂中浸种1-2小时再种植。第二种是农业防治，做好水肥、清园等工作就可有效治疗。第三种是化学防治，用氟硅唑乳油+代森锌可湿性粉剂喷雾或用甲基硫菌灵可湿性粉剂。
平衡施肥；发现中心病株拔除深埋；划分病区和健区，浇水时分开浇。青枯立克100-200倍+大蒜油1000倍+沃丰素600倍喷雾+灌根，病情控制后转为预防。
选用抗病品种，对苗床土壤药剂处理，合理轮作倒茬，初发现病株的地，要立即喷药，药剂可用40%福星乳油8000倍液或20%氟硅唑咪鲜胺800倍液，或75%百菌清可湿性粉剂600倍液或56%嘧菌酯百菌清800倍液，每隔5～7天喷一次，连喷2～3次。
播种前用36%三唑多菌灵悬浮剂100倍液浸种30分钟晾干后直播。用抗病品种，施足基肥，以优质复合肥为主，忌偏施氮肥。移栽前三至五天，每亩用多菌灵悬浮剂500倍液喷雾，带药移栽。苗期四叶龄前用10%苯醚甲环唑水分散粒剂1200拜一或75%敌克松可溶性粉剂1000倍液灌根。发病初期喷药防治药剂和水用36%，三唑多菌灵悬浮剂500倍液每隔五至七天防治一次，视病情连续防治一至三次。