玉米缺磷嫩株敏感，植株矮化，叶尖、叶缘失绿呈紫红色，后叶端枯死或变成暗紫褐色。幼苗期缺磷，茎和叶片暗绿带紫红色，从下部叶片开始，先是叶尖干枯，沿叶缘向基部蔓延，进而呈暗褐色，以后逐渐向幼嫩叶片发展，根系发育不良，茎部衰弱，细长。孕穗至开花期缺磷，糖代谢与蛋白质合成受阻，雌穗减少，分化发育不良，花丝延迟抽出，授粉受阻，使受精不良，籽粒不充实，甚至空穗，并且会出现果穗卷曲，穗顶缢缩，会出现秃顶、缺粒与粒行不整齐现象。玉米缺磷在幼苗期和开花期都会出现不同的症状，幼苗期缺磷玉米下部叶片开始出现暗绿色，并且从边缘开始出现紫红色；开花期缺磷秃顶、缺粒与粒行不整齐等症状。
幼苗生长缓慢矮缩，根系发育差，叶片不舒展，茎和叶是暗绿而带紫色，叶尖干枯而成暗褐色。紫色是因玉米植株体内糖代谢受阻，叶中积累糖分较多，促进花色素苷的形成，使植株带紫色。孕穗至开花期缺磷，糖代谢与蛋白质合成受阻，果穗分化发育不良。穗顶缢缩，甚至空穗，花丝也会延迟抽出，容易出现秃顶、缺粒与粒行不整齐、果穗弯曲等现象。