辣椒疮痂病发生期喷施农用链霉素防治。
2％多抗霉素800倍液，或60％DTM可湿性粉剂500倍液，或14％络氨铜水剂300倍液，或27％氧氯化铜悬浮剂600倍液，或78％波·锰锌（科博）可湿性粉剂500倍液，或50％氯溴异氰尿酸（消菌灵）可溶性粉剂1200倍液，或60％琥铜·乙铝·锌可湿粉剂500倍液等药剂喷雾防治，重点喷洒病株基部及地表，使药液流入菜心效果为好。每7天喷l次，连喷3～4次。
喷用药物浓度按标准用量不能提高，高温时应保证湿度。
剔除炭疽病株。或及时喷施药剂。
选择抗病品种，实施轮作，做好水肥管理等。