甘蔗黑穗病主要危害蔗茎梢部。蔗株感染黑穗病后，早期表现叶淡绿、细长，分蘖增多，茎细小，萌芽增生等症状。甘蔗黑穗病最明显的特征是病蔗梢部具有1条向下卷内的黑色鞭状物。鞭中央是由薄壁组织或维管束组织构成的心柱，外围包着一层厚垣孢子。甘蔗受害后，生长点因受病菌刺激抽发出一条鞭状物，长度可由10～100cm，似铅笔般粗细。初长出时呈白色，外表有一银灰色的薄膜包裹，后期鞭状物成熟变黑色，薄膜破裂散出黑粉，这就是病菌的厚垣孢子。黑粉散尽后便剩下一条灰白色维管束纤维组织。
(1)因地制宜选用抗病品种。如华南56/12、粤糖57/423、粤糖63/237、川蔗7号、川蔗11号等。(2)实行轮作。与水稻、玉米、甘薯、花生或苜蓿等作物轮作。(3)增加新植面积，种植无病种苗。从无病区调种。在病区要选留无病株的第一度梢头苗做种。(4)最好在抽出黑穗前拔除病株。抽出黑鞭的要小心剪下放在塑料袋内，带出田外集中烧毁。病田不留宿根，病株残茬也要烧毁。(5)施足基肥，注意氮磷钾肥合理配合施用。适时灌水，及时培土，防止倒伏，减少侧芽生长。
(1)因地制宜选用抗病品种。如华南56/12、粤糖57/423、粤糖63/237、川蔗7号、川蔗11号等。(2)实行轮作。与水稻、玉米、甘薯、花生或苜蓿等作物轮作。