病菌以菌丝体或菌核的形式随病残体在土壤中越冬，也可以分生孢子在鳞茎表面越冬。但在气候温暖地区，多以分生孢子在病残体上越冬。翌年春天条件适宜时产生分生孢子。分生孢子借气流或雨水反溅传播，病菌从气孔或伤口等侵入叶片，引起初侵染。病部产生的分生孢子随气流、雨水和农事操作等传播，进行再侵染。
分生孢子通过气流、雨水传播，从气孔或伤口等侵入叶片，引起初侵染。病部产生的分生孢子借气流、雨水或农事操作传播，进行再侵染。
韭菜灰霉病主要靠病叶上的灰霉传播蔓延。每次收韭菜都会把病菌散落于土表，致新生叶染病。秋末冬初多在塑料大棚内发病，由于韭菜棚生态条件适合发病，只要有菌。