玉米锈病主要危害叶片，发病初期，在叶片两面散生或聚生淡黄色斑点，突起形成红褐色疱斑，后小疱破裂，散出铁锈色粉状物，即病原夏孢子。后期病斑形成黑色近圆形突起，开裂后露出黑褐色孢子，即病原冬孢子。玉米锈病发生严重时，叶片上布满孢子堆，造成大量叶片枯死，失去光合作用，消耗全株的营养和水分，植株早衰，籽粒不饱满，导致减产。最严重时，可造成叶片从受害部位折断，全株干枯，减产严重。
玉米锈病是转主寄生病害，感染玉米叶茎，表现叶片上着生锈色孢子堆。
玉米锈病病害症状主要是叶面有铁锈红。
主要侵害玉米叶片，严重时果穗、苞叶和雄花也可受害。被害叶片初在两面散生或聚生淡黄色小疱斑（此为病原菌未发育成熟的夏孢子堆），随着病菌的发育和成熟，疱斑扩展为圆形至长圆形，明显隆起，颜色加深至黄褐色，终致表皮破裂散出铁锈色粉状物（即病原菌夏孢子）；后期病斑上或其附近又出现黑色疱斑（此为病原菌有性态的冬孢子堆），疱斑破裂散出黑褐色粉状物（即病原菌冬孢子）。但在南方温暖地区，特别是广东，病菌冬孢子堆不一定产生。
病斑布满叶片，叶片枯死，失去光合作用。