在发病初期使用异菌脲或咯菌腈或腐霉利喷雾防治。同时注意温光气水肥相互协调。
西葫芦菌核病主要危害西葫芦的果实和茎蔓，诊断特征是病部前期长出白色棉毛状菌丝，后期纠结形成黑色鼠粪状菌核。茎染病时，多从靠近地面的茎部发病，产生褪色水渍状斑，后逐渐扩大呈淡褐色，高湿条件下病茎软腐，长出白色棉絮状菌丝。
提前预防，及时喷药，防早，防小，防了。
西葫芦菌核病单位综合防治措施是抗病品种选择，轮作倒茬，土壤消毒，培育壮苗及加强田间管理等。
一、选择良种。二、整地施肥。1.精细整地。2.做畦开沟。3.平衡施肥。三、适期适量播种：1种子处理。2适期播种。3播种量。四、科学田间管理：1.科学施肥与除草。2.病虫害防治以预防为主，综合防治。五、适时收获。
选用抗病品种，加强田间管理。