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花期出现降雨，首先最直接的影响就是花粉。一来花粉成熟后，如果遇雨，花粉就会吸水膨胀，甚至破裂，不能到达子房参与受精；二来花期遇雨后，柱头上的粘液被稀释，粘着花粉的能力下降，到达柱头的花粉能吸收的营养减少，活力下降，花粉在柱头上发育的时间延长，从柱头到子房的速度变慢，到期达子房的花粉数量减少，活力变差。
花期遇雨会影响苹果授粉，降低座果率。
