流产胎儿脑水肿，皮下血样浸润，肌肉似水煮样，腹水增多；木乃伊胎儿从拇指大小到正常大小；肝、脾、肾有坏死灶；全身淋巴结出血；肺瘀血、水肿。子宫粘膜充血、出血和有粘液。胎盘水肿或见出血。公猪睾丸实质充血、出血和小坏死灶；睾丸硬化者，体积缩小，与阴囊粘连，实质结缔组织化。
猪流行性乙型脑炎的病理变化：母猪子宫内膜充血、水肿，黏膜表面覆盖有大量黏性分泌物，刮除后可见黏膜糜烂和小点状出血。早产仔猪多为死胎，死胎大小不一，黑褐色，小的干缩而硬固，中等大的茶褐色、暗褐色，皮下出血、胶样浸润，发育到正常大小的死胎，多因脑水肿而头部肿大，皮下弥散性水肿，腹水增多，脑、脊髓膜充血、出血。