主要是生产工艺不同.复合吧通过重新造粒;而复混肥是机器混合。
复合肥与复混肥是两种不同类型的化学肥料，二者的主要区别有四点：一是生产工艺不同。复合肥是通过化学反应合成，其养分含量均匀，颗粒大小一致，而复混肥是通过物理混合而成，其生产工艺简单，养分不均，效果较差。二是养分含量不同。复合肥养分相对固定，氮、磷、钾各为15%，硫为30%，而复混肥浓度低，总养分一般不超过30％。三是养分利用率不同。化学反应合成的复合肥养分释放均匀，利用率高，而物理混合的复混肥养分释放不均衡，会造成作物养分吸收过程中的浪费和缺乏。四是执行标准不同。不论复混肥还是标识为复合肥的复混肥，一般都标识为GB15063－94，而复合肥的标识标准则不同，都是执行的企业标准。
复合肥是用化学方法将两种或两种以上的养分结合在一起的肥料，如磷酸二氢钾等，复混肥是用物理方法将两种或两种以上的养分混合在一起的肥料，如三元复混肥BB肥等。
复合肥是通过化学反应合成而复混肥是通过物理反应合成。
复合肥是化学合成，复混肥是物理过程。
复合肥只有一种颗粒，复混肥有多种颗粒。
复合肥和复混肥的主要区别就是生产工艺不同，复合肥需要重新造粒，而复混肥只需要把氮磷钾及微量元素用机器混合即可。
复合肥和复混肥生产方式不同，复合肥是经过精加工生产的，复混肥是几种肥料混合而成的。
复合肥是用化学方法制成，复混肥用物理方法制成。
一种物理混合法生产出来的叫复混肥；另外一种是含有氮磷钾元素，经过化学反应后形成的叫复合肥。