小麦根腐病防治以防为主，治疗为辅，结合园艺措施、生态调控、生物防治，辅以科学用药防治。
小麦病虫害应该坚持预防为主综合防治。
小麦根腐病治疗方法主要是药剂防治。
1、轮作倒茬。小麦收获后，将麦株病残体充分清除出麦田，集中沤肥或销毁。提倡小麦与玉米、油菜等作物轮作，降低病原菌在土壤中的存活量。2、合理施肥。施用农家肥，均衡施肥，实行测土配方施肥。3、提高播种质量。播种时将土壤整平、整细，播种深度3～4厘米。
发病初期用甲霜灵、霜霉威液灌根防治；一周后用枯草芽孢杆菌淋根防治。
加强田间管理及病虫害防治。
加强田间管理和病虫害防治。
加强田间管理，有效防治病虫害。
药剂拌种，发病初期喷药防治，适当补水肥。
小麦根腐病防治要清洁田园，土壤处理，实行轮做倒茬。