此病菌半腐生性强，发病重的地段应与非葱蒜类作物实行3～4年轮作。因病菌可附着在种子上传播，可用50%福美双、50%多菌灵或50%托布津可湿性粉剂，按种子重量的0.4%进行药剂拌种。在发病初期，可喷洒75%百菌清可湿性粉、64%杀毒矾可湿性粉剂、70%代森锰锌、40%大富丹可湿性粉剂、58%甲霜灵锰锌对水500倍，或50%扑海因可湿性粉剂对水1500倍。如有葱蓟马同时为害，可在上述农药中选择能与2.5%溴氰菊酯或20%速灭杀丁乳油混用的，以兼治葱蓟马。
洋葱紫斑病主要是用化学药剂喷洒防治。
紫斑病是洋葱的主要病害之一，应加强防治。在种植前先清洁土壤，将洋葱浸种后播种，生长中合理施肥，并加强管理提高抗病能力。
科学管理，水肥充足预防病虫害。