发病初期，用20%病毒A可湿性粉剂500倍液，或1.5%植病灵乳剂1000倍液，或20%盐酸吗啉胍可湿性粉剂500～600倍液，或5%菌毒清水剂500～600倍液防治，每7～10天喷1次，连喷3～4次。
发病初期用2%菌克毒克水剂200-250倍液，或20%病毒A可湿性粉剂500倍液，或1.5%植病灵乳油1000倍液，或30%病毒K可湿性粉剂800倍液，或20%小叶敌1000倍液等与防治蚜虫的药剂混用，喷雾防治。每隔7天1次，连续2-3次。对于蕨叶型症状可添加“奇宝920”，防治效果好。
西瓜病毒病用磷酸二氢钾或病毒A叶面喷施。
发病初期开始喷20%病毒A可湿性粉剂500倍液，或1.5%治病灵乳剂1000倍液，或抗病毒剂一号300倍液，或喷0.2%磷酸二氢钾，以增强植株抗病性。
西瓜病毒病发病初期可喷20%病毒A可湿性粉剂500倍液，或1.5%治病灵乳剂1000倍液，或抗病毒剂一号300倍液，或喷0.2%磷酸二氢钾，增强抗性。
西瓜在播种时干籽用70℃温水浸种10分钟可杀死病毒，或浸种3小时的湿籽用0.1%-1.0%的高锰酸钾溶液浸种30分钟，也可用10%磷酸三钠溶液浸种20分钟，用清水洗净后播种。