本病由半知菌亚门真菌灰葡萄孢引起。病菌可以菌核遗留在土壤中，或以菌丝、分生孢子在病残体上越冬。病菌对湿度要求很高，一般12月至翌年5月连续相对湿度90％以上易发病。大棚持续较高的相对湿度是造成该病发生和蔓延的主导因素，尤其在连阴雨多的年份，气温偏低，放风不及时，棚内湿度大，会使灰霉病突然暴发和蔓延。此外，植株密度过大、生长旺盛、田间郁闭、管理不当都会加重本病的发生和蔓延。光照充足对该病扩展有很强的抑制作用。露地春播，遇低温多雨时也常会严重发生和蔓延。
辣椒灰霉病的病原以菌核在土壤中，或以菌丝、分生孢子在病残体上越冬。病菌孢子随气流及雨水传播蔓延。
传播途径有农事操作传播、空气传播、昆虫传播、雨水传播、病残体传播。
病菌以菌丝、菌核或分生孢子在病残体上或遗落在土壤中越冬，分生孢子随气流或农事操作传播蔓延。
年度间早春温度偏低、多阴雨、光照时数少的年份发病重；田块间连作地、排水不良、与感病寄主间作的田块发病较早较重；栽培上种植过密、生长过旺、通风透光差、氮肥施用过多、与生菜、芹菜、草莓等易发灰霉病的作物接茬的田块易染病，特别是保护地春季阴雨连绵、气温低、关棚时间长棚内湿度高、通风换气不良，极易引发病害。