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西瓜立枯病主要发生在苗期，根茎部干枯坏死。
两瓜秧苗发立枯病后，在茎基部缢缩，叶片枯死，但秧苗不倒伏。
西瓜立枯病多发生在秧苗的中、后期。西瓜种子未出土前受害，造成烂种。刚出土的幼苗受害，茎基部产生椭圆形暗褐色病斑，病苗白天萎蔫，夜间恢复正常，当病斑绕茎一周时，病部凹陷，茎基部干枯缢缩，幼苗倒伏死亡。中期以后的幼苗，因茎部已木质化，茎基部虽然发病，病苗仍直立不倒，故名立枯病。在湿度大的条件下，被害部位长出白色霉层，稍大病苗的病部产生蛛网状淡褐色霉层。
