①猝倒病、立枯病及沤根病等：番茄苗期易发，可用72.2%普力克水剂400倍液或绿亨1号2500倍液进行防治。对于寒根、沤根现象要通过松土提升地温，减少浇水，避免土壤湿度过大等措施加以解决。
②病毒病：发现病株时要及时治疗。可采用5%菌毒消可湿性粉剂或0.5%抗毒剂1号300倍液。
③灰霉病：可在喷花时加入5%扑海因或50%农利灵1000倍液进行喷花。冬春茬可选用45%百菌清烟剂每亩250克进行熏烟。此外，还可选用65%抗霉威可温性粉剂1000～1500倍液进行喷雾。
④叶霉病：可选用叶霉杀星、福星等药剂进行防治。
⑤枯萎病：可选用抗枯灵、根腐灵等灌根防治。
⑥青枯病：可选用细菌力克、细菌灵、农用链霉素、可杀得等进行喷雾及灌根。
⑦晚疫病：可选用克抗灵、普力克、杀毒矾、雷多米尔等药剂。
⑧虫害主要有棉铃虫、蚜虫、烟青虫、白粉虱等地上害虫和地老虎、蝼蛄、蟋蟀等地下害虫。防治地上害虫可选用农地乐、功夫、吡虫灵等药剂防治。对于地下害虫主要采用毒饵法进行灭杀。