稻曲病最好在抽穗前15天第一次防治，抽穗期和齐穗后结合稻瘟病的防治再次防治。药剂可选择“爱苗”等。
首先是选用抗病品种；其次是合理施肥，增施P、K肥，改传统的施肥方法为平衡促进法，同时合理灌水，健生栽培，建立适群体、壮个体的高产群体；第三是提倡适时施药预防，经研究表明，稻曲病的预防适期为破口前5-7天（即剑叶抽出至三分之一时）和破口期。一般预防二次，第一次预防可选用5%井冈霉素水剂，每亩200毫升，第二次预防可选用12%曲纹星可湿性粉剂，每亩50克。
以预防为全，可用稻库喷雾防治。
在水稻破口前七天和齐穗后各用爱苗，好力克防治。
水稻稻曲病在破口前10-15天选用戊唑醇、已唑醇防治。
实际就用井冈粉，浓点。少施氮肥可降低发生。
在水稻破口前7天用苯甲.嘧菌脂预防，齐稳期再防一次。
稻曲病在破口前7至14天防治效果好，药剂用爱苗，戊唑醇等。
选用抗病品种，合理施肥，适时适量用药。