异菌脲的防治对象包括烟草病害、药材病害、油料作物病害、亚麻及胡麻病害、水稻病害、观赏植物病害、玉米病害等。
烟草病害：防治烟草赤星病，可亩用50–60克50%可湿性粉剂兑水50公斤做喷雾处理，每隔7-10天喷1次，连喷3-5次。
药材病害：防治人参、三七等药材上面的黑斑病，可在发病初期喷施50%可湿性粉剂1000-1200倍液，每隔7-10天喷1次。
一、异菌脲的防治对象
1、烟草病害
（1）防治烟草赤星病，在脚叶采收后发病初期，亩用50%可湿性粉剂50–60克加水50千克喷雾，或喷50%可湿性粉剂1500倍液，7–10天喷1次，连喷3–5次。
（2）防治烟草枯萎病，于发病初期，用50%可湿性粉剂1000–1200倍液喷酒或浇灌，每株灌药液400–500毫升，连灌2–3次。
（3）防治烟草菌核病，于发病初期，用50%可湿性粉剂100倍液喷淋烟株根茎部及周围土壤，10天左右喷淋1次？连喷3–4次。
2、药材病害
（1）包括人参、西洋参、党参、北沙参、三七、板蓝根的黑斑病。
（2）防治时，用50%可湿性粉剂400倍液浸种子或种苗5分钟；田间于发病初期喷50%可湿性粉剂1000–1200倍液，7–10天喷1次，采前7天停止施药。
（3）防治党参和佛手的菌核病、贝母灰霉病、百合和肉桂的叶枯病时，于发病初期喷50%可湿性粉剂1000–1500倍液，10天左右喷1次，连喷3–4次。
3、油料作物病害
（1）防治油菜菌核病，在油菜始花期各施药1次，每亩次用50%可湿性粉剂或悬浮剂75–100克，对水60–75千克喷雾。
（2）防治花生冠腐病，播前每100千克种子用50%可湿性粉剂100–300克拌种后再播种。
（3）防治向日葵菌核病，播前每100千克种子用50%可湿性粉剂400克，拌种后再播种。
4、亚麻、胡麻病害
防治亚麻、胡麻的假黑斑病、菌核病，于发病初期喷50%可湿性粉剂1500倍液。
5、水稻病害
防治水稻胡麻斑病、纹枯病、菌核病，于发病初期开始，连续施药2–3次每亩次用50%可湿性粉剂或悬浮剂67–100克，对水喷雾。
6、观赏植物病害
（1）防治观赏植物叶斑病、灰霉病、菌核病、根腐病，于发病初期开始、每隔7–14天喷药1次，每亩次用50%可湿性粉剂或悬浮剂75–100克，对水常规喷雾。
（2）插条可在50%可湿性粉剂或悬浮剂200–400倍液中浸泡15分钟后再插。
7、玉米病害
防治玉米小斑病。于发病初期，亩用50%可湿性粉剂或悬浮剂200–400克对水50千克喷雾，以后隔15天再喷1次。
二、异菌脲不能与哪些药物复配
1、不能与异菌脲复配的药剂
（1）异菌脲不可与作用与机理相同的杀菌剂混用或者轮用，例如：腐霉利、乙烯菌核利等。
（2）异菌脲不能与具有强碱性或者强酸性的药剂混在一起使用。
2、能与异菌脲轮用的杀菌剂
通常在生产上，异菌脲可与像百菌清、甲基托布津、代森锰锌等这样的杀菌机理并不相同的杀菌剂轮用或混用。